دنیای زنده بدون حضور پپتیدها قابل تصور نیست. این پلیمرهای زیستی به ظاهر کوچک، نقش بزرگی را در سیستم ­های زیستی ایفا می ­نمایند. هورمون ­های پپتیدی و انتقال دهنده ­های عصبی اصلی ­ترین تنظیم­ کننده ­های بدن موجودات زنده به شمار می­ آیند. شيمي پپتيد ماهيت بين رشته اي دارد و بخوبي ارتباط موثر و مناسبی بين رشته­ هایي نظير بيوشيمي، بيولوژي مولکولي، شيمي دارويي و بيوتکنولوژي را برقرار ساخته است. همچنین پتانسيل مناسبي جهت ارتباط با ساخت ميکروراکتورها، بيوراکتورها و نیز مهندسي کنترل را دارا است. لذا، قرن آینده بعنوان قرن کدهای بیولوژیکی نام گذاری شده است و در این میان، پپتیدها به دلیل ساختار طبیعی تنوع خواص بیولوژیکی، دارویی و اثرات سمیت کمتر جایگاه ویژه ­ای پیدا کرده ­اند.

خانواده ترکیبات پپتیدی، دارای خواص دارویی گسترده و متنوعی نیز هستند، بطوری­که در حال حاضر بیش از 240 نمونه پپتیدی مراحل نهایی کلینیکی را می ­گذرانند و بزودی حجم وسیعی از بازار دارویی را به خود اختصاص خواهند داد. بازار داروهای پپتیدی بیش از سالیانه 20 میلیارد دلار می­ باشد و تعداد زیادی از این ترکیبات، در داخل کشور نیز جهت درمان بیماری­ های مختلف مورد استفاده قرار می ­گیرند. در حال حاضر، ساليانه جهت واردات داروهاي مذكور ده­ ها ميليون دلار ارز ازكشور خارج مي ­شود. بدين خاطر تحقيق و نهاﻳتاً توليد مقرون به صرفه اين تركيبات در داخل كشور، مي­ تواند ضمن بي­ نياز كردن كشور از واردات آنها و كاهش خروج ارز ،زمينه­ ساز دانش فني نوين در كشور نیز باشد.

با عنایت به موارد یاد شده و به منظور گسترش پژوهش در زمینه تولید مواد اولیه دارویی و داروهای نوین پپتیدی و کمک به رفع نیازهای پژوهشی کشور در زمینه­ های متنوع سنتز ترکیبات آلی، مواد مؤثره دارویی و داروهای پپتیدی و نیز سنتز پپتيدهاي نوين به خصوص پپتيدهايی که در نانو بيوتکنولوژی دخالت دارند، پژوهشکده شیمی پپتید بعنوان نخستین پژوهشکده دانشگاهی فعال در این زمینه تخصصی، از سال 1385 فعالیت خود را شروع نموده و در حال حاضر ضمن تربیت نیروهای با کیفیت علمی در مقطع کارشناسی ارشد و دکتری، توانسته است دانش فنی چندین ترکیب پپتید دارویی را نیز بدست آورد.

در این راستا، پژوهشکده در تلاش است تا نه تنها با برقراری تعادل بین ماموریت ها در زمینه­ هایی که دانشگاه متولی اصلی آن هاست، قدم های مؤثری برداشته و در منطقه، بهترین عملکرد آموزشی، تربیتی، علمی و جهت­ مندی را داشته باشد، بلکه برآن است تا با تلاش برای دستیابی به فن آوری و دانش روز در حوزه شیمی پپتید و با دستیابی به فناوری تولید تعدادی از اقلام مهم داروهای پپتیدی، به جلوگیری از خروج ارز در قالب ورود داروهای خارجی به کشور (بیش از ده ها میلیون دلار در سال)، کمک نماید.

با عنایت به موارد یاد شده، پژوهشکده شیمی پپتید سه گروه پژوهشی با عناوین ” گروه پژوهشی بیوکاتالیست ­ها و پپتیدهای طبیعی ” ، “گروه پژوهشی پپتیدهای نوین دارویی” و “گروه پژوهشی سنتز پپتیدها” را در نمودار سازمانی خود قرار داده که براین اساس، قادر به سنتز مواد مؤثره دارویی (API) و ترکیب های پپتیدی با خواص متنوع داروئی مثل ضد سرطان، ضد دیابت، ضد درد و همچنین خانواده(Gonadotropin Releasing Hormone)  GnRH می ­باشد. همچنین، طی سال های اخیر، با تلفیق شیمی پپتید و شیمی ترکیبات هتروسیکل فعال بیولوژیکی، ترکیبات متنوعی با خاصیت بیولوژیکی مؤثر در این پژوهشکده سنتز شده ­اند. با توجه به قابلیت ­های موجود و همچنین موارد مورد نیاز کشور، این پژوهشکده توان انجام فعاليت های تحقيقاتی، خدمات مشاوره­ای، خدمات آزمايشگاهی، خدمات آموزشی_تحقيقاتی و سنتز انواع مواد مؤثره داروئی، پپتيدی و هتروسیکلی را دارد، که در صورت تمایل جهت انجام هر یک از موارد درخواستی، جزئیات بیشتری ارائه خواهد شد.