در این آزمایشگاه، سنتز نمونه ­های پپتیدی درخواستی یا مواد مؤثره داروئی، با روش­ های سنتز دستی و دستگاهی انجام می­شود. کلیه تجهیزات لازم و معمول مورد نیاز سنتز ترکیبات آلی در این آزمایشگاه فراهم شده که در ادامه به برخی از آنها اشاره شده است.

سایر امکانات مورد نیاز جهت سنتز مواد مؤثره داروئی، به همراه تجهیزات آزمایشگاهی مختلف در آزمایشگاه موجود می باشد.